Производи

Повреда на црниот дроб предизвикана од лекови е една од главните причини за трошење на лекот.Способноста да се предвидат ефектите на црниот дроб на кандидатите за лекови од нивните хемиски структури е од клучно значење за да помогне во водењето на експерименталните проекти за откривање лекови кон побезбедни лекови.Во оваа студија, ние составивме збир на податоци од 951 соединение за кое е пријавено дека предизвикуваат широк спектар на ефекти во црниот дроб кај различни видови, вклучувајќи луѓе, глодари и неглодари.Ефектите на црниот дроб за овој сет на податоци беа добиени како тврдоглави метаподатоци, генерирани од апстрактите на MEDLINE користејќи уникатна комбинација на лексички и лингвистички методи и онтолошки правила.Го анализиравме овој сет на податоци користејќи конвенционални пристапи на хеминоформатика и се осврнавме на неколку прашања кои се однесуваат на усогласеноста меѓу видовите на ефектите на црниот дроб, хемиските детерминанти на ефектите на црниот дроб кај луѓето и предвидувањето дали даденото соединение веројатно ќе предизвика ефект на црниот дроб кај луѓето.Откривме дека усогласеноста на ефектите на црниот дроб е релативно ниска (околу 39-44%) помеѓу различни видови, што ја зголемува можноста дека специфичноста на видовите може да зависи од специфичните карактеристики на хемиската структура.Соединенијата беа групирани според нивната хемиска сличност, а слични соединенија беа испитувани за очекуваната сличност на нивните профили на ефект на црниот дроб зависни од видот.Во повеќето случаи, слични профили беа забележани за членовите на истиот кластер, но некои соединенија се појавија како оддалечени.Исклучоците беа предмет на фокусирана регенерација на тврдењата од MEDLINE, како и од други извори на податоци.Во некои случаи, беа идентификувани дополнителни биолошки тврдења, кои беа во согласност со очекувањата засновани на хемиските сличности на соединенијата.Тврдењата дополнително беа претворени во бинарни прибелешки на основните хемикалии (т.е. ефект на црниот дроб наспроти ефект на црниот дроб), а беа генерирани модели на бинарни квантитативни квантитативни односи структура-активност (QSAR) за да се предвиди дали соединението ќе се очекува да произведе ефекти на црниот дроб кај луѓето.И покрај очигледната хетерогеност на податоците, моделите покажаа добра предвидувачка моќ проценета со надворешни 5-кратни процедури за вкрстување.Надворешната предиктивна моќ на бинарните QSAR модели беше дополнително потврдена со нивната примена на соединенија кои беа пронајдени или проучувани по развојот на моделот.Според нашите сознанија, ова е прва студија за предвидување на хемиската токсичност која применила QSAR моделирање и други хеминоформатички техники на набљудувачки податоци генерирани со помош на автоматско ископување текст со ограничено рачно насочување, отворајќи нови можности за генерирање и моделирање хемиска токсикологија податоци.