Производи

Користена е инфрацрвена спектроскопија за мапирање на интеракциите супстрат-протеин: конформациските промени на саркоплазматскиот ретикулум Ca(2+)-ATP-аза при врзување со нуклеотид и фосфорилација на ATP-аза беа следени со користење на супстратот ATP и ATP аналози (2'-деокси-ATP, 3 '-деокси-ATP, и инозин 5'-трифосфат), кои беа модифицирани во специфични функционални групи на подлогата.Модификациите на 2'-OH, 3'-OH и амино групата на аденин го намалуваат степенот на конформациската промена на АТПазата предизвикана од врзување, со особено силни ефекти забележани за последните две.Ова ја демонстрира структурната чувствителност на комплексот нуклеотид-ATP-аза на поединечни интеракции помеѓу нуклеотид и АТПаза.Сите проучувани групи се важни за врзување и интеракциите на дадена лиганд група со ATP-аза зависат од интеракциите на другите групи на лиганди.Фосфорилацијата на ATP-азата беше забележана за ITP и 2'-деокси-ATP, но не и за 3'-деокси-ATP.Не постои директна врска помеѓу степенот на конформациска промена при врзување на нуклеотид и брзината на фосфорилација што покажува дека целосниот обем на конформациската промена предизвикана од АТП не е задолжителна за фосфорилација.Како што е забележано за комплексот нуклеотид-ATP-аза, конформацијата на првата фосфорилирана АТПаза посредник E1PCa(2) исто така зависи од нуклеотидот, што покажува дека состојбите на АТПаза имаат помалку униформа конформација од претходно очекуваното.